109學年度起，依本校發展特色，打造一個具有系統且目標性學習願景與教學模式，結合USR議題及SDGs指標，陸續組成三大面向16個類型的跨領域微學程，包含：(1)文化永續：東臺灣藝文創作人才培育、從地方風土到編輯出版、社會實踐、美學實踐、兒童文學與文化、南島文化等6個跨領域微學程。(2)產業鏈結與經濟永續：產業六級化新創商業模式、在地數位治理、創意設計、創意觀旅、綠色能源科技等5個跨領域微學程(3)健康促進：適應體育、生物醫學資料庫、海洋休閒、山林遊憩、自然體驗等5個跨領域微學程。藉由6至9學分的探索課程，使學生能自我探索學習脈絡，尋找未來發展方向，達到自主學習和跨領域合作。

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